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科研绘图
火山图生成器
专为差异表达分析设计。输入 Log2FC 和 P-value,自动生成标准的火山图,快速识别显著上调和下调的基因。
实时预览
差异表达基因火山图
数据来源: RNA-seq 分析制图: 颜色代码表
什么是火山图 (Volcano Plot)?
火山图是一种散点图,常用于基因表达分析(如 RNA-seq, Microarray)中展示差异表达数据。 图表左上角和右上角的点通常是我们需要关注的“显著差异基因”(P值小且倍数变化大)。横坐标为 Log2FC,大于 0 表示上调(Up),小于 0 表示下调(Down);纵坐标为 -Log10(P-value),值越大表示 P 值越小,结果越显著。通常取 P < 0.05 (即 -Log10 > 1.3) 和 |Log2FC| > 1 作为显著性阈值。上调和下调的基因会分布在图表上方两侧,形状酷似火山喷发,故得名火山图。
如何解读火山图?
- 右上角 (上调)Log2FC 为正且 P-value 显著。代表基因在实验组中表达量显著上调。通常用红色表示。
- 左上角 (下调)Log2FC 为负且 P-value 显著。代表基因在实验组中表达量显著下调。通常用蓝色或绿色表示。
- 下方灰色区域 (无显著)P-value 不显著(通常 > 0.05)或差异倍数太小。这些基因被认为没有统计学意义上的变化。
功能亮点
- 动态阈值: 拖动滑块即可实时调整 P-value 和 Log2FC 的切割线,观察显著基因数量的变化。
- 数据模拟: 内置随机数据生成器,方便在没有真实数据时演示图表效果。
- CSV 导入: 支持直接粘贴或上传标准格式的差异分析结果表,一键生成出版级图表。
常见问题 (FAQ)
为什么要对 P 值取 -Log10?
P 值通常非常小(如 0.00001),直接绘图会挤在 X 轴附近。取负对数后,P 值越小,Y 轴数值越大,显著的点会“飞”到图表上方,便于观察和区分。
Log2 Fold Change 是什么意思?
Fold Change 是表达量的倍数变化。取 Log2 是为了让上调(倍数>1)和下调(倍数<1)在轴上对称。例如,上调 2 倍 Log2FC=1,下调 2 倍(即 0.5)Log2FC=-1。这样图表左右对称,更美观直观。
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